События аниме разворачиваются во временной линии бета. Парень по имени Ринтаро Окабэ совершает одно за другим путешествия во времени, рассчитывая, что найдет способ спасти свою возлюбленную, однако по чистой случайности вместо того, чтобы помочь ей, он ее убивает. Чувство вины не дает парню покоя, да и посттравматический синдром ситуацию не упрощает.
Но однажды главный герой узнает о существовании программы, посредством которой человеческое сознание можно перенести в искусственный интеллект. Вскоре оказывается, что подруга Курису, погибшей любви Ринтаро, создала «Амадеус», интеллект, в который была скопирована память девушки и с ней можно разговаривать, как с живой.
